毛豆的病害主要有5种，病毒性病害一种，即大豆花叶病，而真菌性病害有4种，即霜霉病、根腐病、锈病、炭疽病。

大豆花叶病

大豆花叶病主要是由大豆花叶病毒、花生条纹病毒、大豆矮化病毒、烟草坏死病毒、苜蓿花叶病毒等多种病毒感染所引起的，有时是单独侵染，有时是混合侵染。这些病毒一般靠蚜虫或人为的农事操作传播，如果田间管理条件差，气候干旱，蚜虫量大，则病害就重。

霜霉病

霜霉病由霜霉菌引起，霜霉菌是专性寄生菌。此病从幼苗到收获各阶段都可发生，最适发病温度为20~22℃，10℃以下或30℃以上，霜霉菌不能形成孢子囊，霜霉菌卵孢子形成的最适温度为15~20℃。每年7月至8月多雨高湿，易引发病害，而干旱低湿则不利此病害发生。因此，湿度也是很重要的发病条件。

根腐病

此病是由腐霉、疫霉、镰刀菌等多种病原侵染所引起。毛豆根腐病发病的原因，主要有以下几点。一是土壤粘重，地势低洼，排水不良；二是管理不当，造成土壤板结，透气性差，根系积水腐烂；再是害虫危害或作物有伤口，病菌从伤口侵入。

锈病

毛豆锈病由担子菌亚门真菌属中的豆层锈菌侵染引起，温暖、多雨、潮湿的环境容易发病。豆层锈菌以夏孢子作为初侵，然后再侵接种体，而后又借风雨传播，使得病害年年发生，循环不止。

炭疽病

毛豆炭疽病由大豆炭疽病菌侵染所引起，为害茎及荚，也为害叶片或叶柄，发病率一般为10%～20%。病菌发病最适温度为25℃，在12～14℃以下或34～35℃以上，一般不能发育。大豆炭疽病菌能在毛豆种子或病残体上休眠，第二年年播种后，会卷土重来，引起发病。