我来回答这个问题~
前言：
BIG MOM作为新世界四皇之一，实力强如怪物，天赋非常高，5岁的时候就毁灭了巨人村，秒杀了巨人族的英雄，有着“天生破坏者”之称，是超人系魂魂果实能力者。
超人系魂魂果实相关资料记载：能够随意处理人的灵魂。让灵魂寄宿在各种各样的东西内使之拟人化，但是不能放进人类的尸体和自己以外的人，被拟人化的物体被称作“霍米兹”。
那么当BIG MOM被海楼石锁住后，魂魂果实能力就被封印了，那万国的灵魂会不会消失呢？我认为是不会的，有以下三点原因。
正文：
首先是，海楼石是封印能力而不是解除能力。
海楼石的相关资料记载：拥有和大海相同的能力，可以理解为固体的海，实际效果超过海，含有名叫RYROBROIN的成分，可以放出和海一样的能量，同时具有极高的硬度，因此可以让恶魔果实能力者失去体力，进而封锁恶魔果实能力。
因此能力者在体力不足的情况下，主动能力不足以使用及维持（包括自然系能力的元素化），但是被动效果不受影响（超人系体质，动物系体质）以及已经放出且不需要体力维持的效果不受影响。
例如布鲁克能够在海面上飞奔，青雉可以冻住海面等等，都说明了海水并不能让能力者失去百分之百的能力（即便是浓缩后的海楼石也是如此）。
而BIG MOM的魂魂果实能力能做的只是随意处理人的灵魂，让灵魂寄宿于各种各样的东西内使之拟人化，这种拟人化并不需要消耗体力，所以即便魂魂果实能力被海楼石封印，万国的灵魂也不会消失。
其次是，在《海贼王》最新剧情中已经有出现魂魂果实被封印的情况了。
在BIG MOM前往和之国的过程中主舰被凯多三灾之一的炎灾烬踢翻，导致BIG MOM失足掉入了大海之中，这种情况下已经等同于魂魂果实被封印的时候了，如果万国的霍米兹出现了异常的话，我相信卡塔库栗第一时间就会用电话虫联系BIG MOM或者陪同在身边的兄弟姐妹们，但是我们从漫画和动漫TV版中，并没有看见这一幕的发生，取而代之是的BIG MOM儿女们对船长位置的争夺。
但是BIG MOM失忆的情况下霍米兹也会跟着“失忆”，比如BIG MOM被乔巴他们发现的时候就出现了失忆症，而其头上的双角帽也跟着失忆，可能是长时间泡在海水中的缘故，因此我觉得失忆的大妈同时也失去了主观上对霍米兹的控制。
最后是，被赋予灵魂的霍米兹也有着对灵魂的控制，部分霍米兹有着独立人格。
比如诱惑森林首领巴姆大王，在被娜美用生命卡胁迫寻找山治，到最后帮助草帽海贼团逃跑，即使BIG MOM在后面追赶命令巴姆大王停下来，巴姆大王也没有听劝，最后被最强霍米兹之一的太阳普罗米修斯烧死，这种种迹象说明所有的霍米兹并不是都受BIG MOM的控制。
因此BIG MOM所拥有的魂魂果实只是可以对灵魂的进行剥夺和赋予能力，被赋予灵魂的霍米兹同样也拥有着对灵魂的控制权，只要BIG MOM不死，这种独有的控制权就会一直存在。
总结：
综上所述，我认为BIG MOM被海楼石锁住后，魂魂果实能力被封印了，但是万国的灵魂不会消失的三个原因就是：
第一：海楼石是封印能力而不是解除能力，对于恶魔果实的被动效果或者不需要体力维持的效果是不会受影响的。
第二：在《海贼王》的剧情中有出现过BIG MOM魂魂果实能力被封印的情况，同样万国的灵魂并没有出现消失的迹象。
第三：被赋予灵魂的霍米兹同样也有着对灵魂的控制，并不是所有的霍米兹都受BIG MOM的控制，甚至部分的霍米兹还有着独立人格。
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