蛋白质分子量是衡量蛋白质大小或质量的一个指标。例如，一些蛋白质的分子量可以决定它们在膜上的定位，以及它们与其他蛋白质、小分子或离子的相互作用。 在此过程中，蛋白质分子量的测定变得至关重要。
一种常用的方法是聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE），它利用电泳技术检测蛋白质分子量。 在SDS-PAGE中，样品蛋白质会被处理成负电荷的线性片段，从而使蛋白质分子电荷相同并被强制“展开”。然后，通过垂直电场，在凝胶中运动，从而分离出根据分子量进行排序的不同蛋白质片段。 随后，可以根据分离的蛋白质片段的相对迁移速率估计其分子量。
近年来，高分辨率质谱技术也成为了测定蛋白质分子量的一种常用技术。 对于高分辨率质谱技术，蛋白质样品首先被离子化，然后通过质谱仪进行分析，从而使蛋白质被根据其重量分选出来。 这种技术的精度更高，同时也能够提供关于其他蛋白质信息的相关数据。
除了上述技术，还有一些其他的技术能够检测蛋白质分子量，例如Gel filtration chromatography（GFC），multi-angle light scattering (MALS) 等等。这些技术在不同情况下可能出现了差异，但它们都共同表明了蛋白质分子量测定的重要性和可行性。