蛋白质是细胞重要的组成部分，也是细胞内相互作用的重要因素。蛋白质相互作用的发现对于生命科学研究具有重要意义。因此，发展蛋白质相互作用检测方法成为了生命科学领域的重点研究之一。本文将详细介绍蛋白质相互作用检测的方法。
1.蛋白质亲和层析法
蛋白质亲和层析法是最常见的蛋白质相互作用检测方法之一。该方法通过利用靶蛋白质和对应的配体蛋白质之间的亲和性进行检测。具体的操作流程是将配体蛋白质固定在层析柱上，经过一系列的处理后，靶蛋白质会与配体蛋白质结合，然后非结合蛋白质被洗掉，最后用洗脱液洗脱结合的蛋白质。亲和层析法的优点是可以检测各种类型的蛋白质交互作用，并且通常有较高的灵敏度和特异性。但是，亲和层析法只能检测两个蛋白质之间的相互作用，并且需要充分纯化蛋白质才能进行检测。
2.荧光共振能量转移法
荧光共振能量转移法是利用两种不同的荧光分子之间的能量跃迁来验证蛋白质相互作用的一种方法。通过将两种荧光分子分别标记在靶蛋白质和配体蛋白质的N末端和C末端，当两个蛋白质相互作用时，荧光分子之间的距离会发生变化，导致能量传递。因此，荧光强度的变化可以作为两种蛋白质之间相互作用的定量指标。荧光共振能量转移法适用于在生理条件下测量单个细胞中蛋白质的相互作用。
3.化学交联法
化学交联法可以通过交联试剂将两个或多个蛋白质共价结合起来，来探测蛋白质之间的相互作用。交联试剂通常是具有两个或更多亲电性官能团的低分子化合物，例如dithiobis (succinimidylpropionate) (DSP)和BS3。这些试剂可以选择性地与蛋白质中的氨基或羟基结合，并形成一个新的交联蛋白物质。通过分离和纯化交联蛋白产物进行鉴定可判断两个蛋白质是否形成交联，从而判断它们之间的相互作用。
4.酵母双杂交法
酵母双杂交法是一种广泛应用的蛋白质相互作用检测方法。该方法利用酵母细胞内的两个域的相互作用将靶蛋白质和配体蛋白质进行捕获。具体实施过程是，将靶蛋白质的DNA序列与一种酵母蛋白质DNA结合区一起构建到表达载体中，配体蛋白质的DNA序列与另一种酵母蛋白质DNA结合区构建到不同的表达载体中。这两个载体在酵母细胞中同时表达，如果两种蛋白质相互作用，则会激活转录因子的表达，并产生酵母细胞的生长。该方法适用于对大规模蛋白质相互作用的分析，但是它的特异性和灵敏度常常受到补体装配和配体蛋白质的拆分等因素的影响。
总之，蛋白质相互作用检测方法多种多样，每种方法各有优缺点，应根据不同的实验目的和特点选择适当的方法进行研究。同时也需要结合其他技术手段，例如质谱分析、免疫共沉淀等进行辅助检测，以更好地研究蛋白质相互作用。