蛋白质分子量是指单个蛋白质分子所含的氨基酸残基数目的总和，其通常用分子量（MW）来表示。测量蛋白质的分子量是生物化学领域中的一个重要问题，因为生物科学家需要确定和比较各种蛋白质的分子量以了解其生化性质和功能。现代生物化学方法可以用于测定分子量，例如凝胶过滤色谱、SDS-PAGE电泳、质谱分析等。
一种可行的方法是使用基于凝胶过滤色谱原理的系统。这是一种高效的分子量分析技术，能够将蛋白质分离并保留在具有不同孔径大小的凝胶层中。当蛋白质样品从上部溶液进入凝胶层时，较大的蛋白质分子会受到阻挡并被留在凝胶层中。较小的蛋白质分子则应该可以通过凝胶层并在底层收集。尺寸和孔径分布差异小的凝胶可用于分离具有接近分子重量（MW）的蛋白质，并且可以定量分离不同范围MW的蛋白质。
SDS- PAGE电泳也是测量蛋白质分子量的一种重要方法。透过SDS方式处理蛋白质样品，使两个或多个半胱氨酸磷酸二酯中的硫原子与SDS中的羧基结合，从而确保蛋白质中带电物质的均匀分布。在应用外部电场的间隔电泳试验中，这些蛋白质可以按照它们的MW由向阳极移动低到高的移动距离排列。任何以差不多的样子经过SDS-PAGE的蛋白质首先是由MW小至大的蛋白质组成。
质谱分析技术由于其高灵敏度和准确性，也是测定蛋白质分子量的另一种重要方法，尤其是在确定蛋白质序列的结构中更为重要。蛋白质质谱分析可以通过利用各种质谱技术，例如飞行时间质谱仪（TOF-MS）或四极杆质谱仪（QQQ）来分离和识别蛋白质分子。峰值的分离方式在蛋白质电泳技术中是普遍应用的，而在质谱技术中也可以用峰值的位置来计算分子量。
综上所述，测量蛋白质分子量是非常重要的。通过底部输送的技术，凝胶过滤分析、SDS-PAGE电泳、质谱分析，都是现代生物化学学家使用的一些标准技术。对于各种目的，包括分离和识别蛋白质分子及确定它们在生物体内核心的作用，分子量（MW）分析是一个强大的分析工具。