蛋白质是由多个氨基酸组成的大分子，其大小可以通过多种方法进行测定，其中常用的方法有质谱法、凝胶过滤法、聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）等。
质谱法是当前最为常用的蛋白质分子量测定方法之一，该方法通过将蛋白质样品离子化，并在质谱仪中进行分析，可以快速、准确地测定蛋白质分子量。Mass spectrometry 试验通常分裂氨基酸出来的分子，因此可以知道蛋白质的具体大小，因此该方法在药物研究和执行的临床试验中得到广泛应用。
凝胶过滤法则是一种分子筛分离技术，该方法通过筛分的分子大小进行分离，分离后分子从大到小分别经过分子筛层，得到每层分子量大小（Dalton）与浓度，从而测定蛋白质分子量大小。该方法具有分离工作量大、花费时间长等缺点。
SDS-PAGE则是一种凝胶电泳技术，可以对蛋白质进行大小分离。通过在凝胶电泳基质中加入一种离子型表面活性剂SDS（十二烷基硫酸钠），将蛋白质分子表面的电性变为负电，并使其线性化，电泳进行后可得到蛋白质分子大小和分离效果更好。
综上所述，测定蛋白质分子量大小的方法种类繁多，科学家们可以根据研究的要求和分子特性选用相应的方法进行实验。