关于祖源这种问题，在基因检测技术已经高度发达的今天其实已经不再是什么秘密了，经常有一些做过y染色体高通检测的中国人惊讶的发现自己在两千年~三千年前左右的时候与一些日本人有同一个祖爷爷，比如我就很惊讶的发现日本的水野氏家族（德川家康他舅舅就是水野氏的）与我属于同一个父系祖源mf23036……
而该父系类型的产生时间不超过2500年 ，大概在秦汉时期左右诞生，这说明日本水野氏家族的祖先确实是来自中国的，
虽然迄今为止有各种各样的假说，但都缺乏科学论证的证据。以遗传信息为基础、解开古代人迁徙路线的研究有望拉开帷幕。 位于爱知县渥美半岛的伊川津贝冢是日本具有代表性的绳文遗迹。2010年在这里出土的大约2,500年前的成人女性骸骨成为了这个研究的重要依据。 以日本金泽大学、北里大学和国立历史民俗博物馆为中心的团队小心采集了头骨中仅存的一点遗传基因，并成功解读了全部遗传信息。2018年7月，金泽大学特
世界历史研究所的汤重南研究员介绍说，日本天皇的血统问题是日本历史学的一段公案，至今无解。即便在日本学者那里也没有统一答案。
首要的原因是因为日本早期历史记载一度是个空白。曾有一位日本律师介绍日本历史的书被翻译到中国，引起史学界关注。他的主要观点是“日本国没有完整的历史，而更多的是神话传说。其中包括许多虚构的历史”。
现在研究者把日本民族的起源归于以下几个版本：（1）来自中国东北通古司的骑马民族；（
日本主体民族为大和族，另外还有阿伊努、琉球、鄂罗克、尼夫赫、朝鲜族等少数民族，今天我们要讨论的是日本的主体民族大和族是不是中国人的后裔？
现在学术界比较公认的看法是，今天的日本人是绳文人和弥生人的混血民族。
现发现最古老的日本人人骨、大约属于2万年前至3万年前的冰河期时代。一般认为绳文人最早于冰河期时代到达日本列岛。冰河期之前的西伯利亚北部气候比较温暖，有大型动物和草木生长，当然现在的西伯利亚比较寒冷
自古以来，日本深受中国文化的影响，包括文字、文学、书法、茶道、医学、服饰、习俗、法律、农耕、工艺技术等等。所以中国一直有一种说法，认为日本人的祖先是中国人。而被提及的最多的，是秦始皇时期沿海东渡的大忽悠——徐福。
当年，秦始皇平定天下、坐稳江山之后，享有到至高权利和尊贵，于是秦始皇开始萌生了想要长生不老的想法。当时担任秦始皇御医的徐福窥见到了秦始皇的这个想法，于是毛遂自荐称《山海经》中记载海中有蓬莱
日本是一个孤岛，资源贫乏，本身产生“猿人”的可能性不大，所以日本人是外来的数波人相互融合最终形成现在的日本人，这一点是肯定的。
由于日本本土列岛距离现中国最近，所以日本人是中国这边的先民一部分逐步移民过去这一点也是毋庸置疑的。
另外，移民肯定不是一蹴而就，应该有一个漫长的过程。
有关移民日本的传说很多，最早的是徐福。
秦始皇让徐福外出找长生不老药，他没找到，不敢回来，于是就在日本自立为王。对此《八仙传》里
日本人为什么现在认为：“他们的祖先起源中国”。1931年8月15日侵略中国东北时，怎么不说中国是你们老祖宗？大逆不道的子孙，没有好下场。
有种说法说日本人的祖先是秦始皇派去的徐福。
徐福携众童男童女东渡为了始皇帝的长生不老仙丹，可是众所周知徐福东渡的行程是有去无回，所以导致了很多人猜想日本人的祖先很可能是徐福？那么徐福究竟是不是日本人的祖先呢？
秦始皇吞并六国后，位高权重，最盼望的就是长生不老。
于是，公元前219年徐福来到秦始皇宫前，声称自己能找到不死药，说是《山海经》中有记载的蓬莱、方丈、瀛洲三座仙岛中有一种不死药。
然而第一次东渡徐福
据说两千年前始皇帝派徐福带领两千童男童女东渡太平洋去一个叫扶桑的国家，至于这个扶桑是不是日本有待考证，有的人说扶桑是日本，有的人说扶桑是韩国朝鲜，有的说是墨西哥，不过很多影视剧不论现代剧还是古代剧还是史学家都验证了一个问题，那就是扶桑就是日本，同时也叫倭国，二战日本侵华期间占领东北三省时自称是第二故乡，以至于到最后日本投降了还有十几万日本侨民不愿意返回日本，当然我说的这个正史和野史都有。